Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prg3Q9JL95 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg3Q9JL95 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms