Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Slc5a3Q9JKZ2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a3Q9JKZ2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms