Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms