Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms