Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nectin1Q9JKF6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms