Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms