Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms