Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms