Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3m1Q9JKC8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms