Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms