Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms