Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms