Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad9Q9JIW5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms