Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sv2aQ9JIS5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2aQ9JIS5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms