Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnmb4Q9JIN6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnmb4Q9JIN6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnmb4Q9JIN6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnmb4Q9JIN6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnmb4Q9JIN6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnmb4Q9JIN6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnmb4Q9JIN6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnmb4Q9JIN6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnmb4Q9JIN6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnmb4Q9JIN6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnmb4Q9JIN6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms