Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus3Q9JI38 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms