Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ropn1Q9ESG2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms