Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtofQ9ESF1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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