Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc4Q9ES56 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms