Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms