Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlnrd1Q9ERE8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms