Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a2Q9EQR4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.3 ms