Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms