Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms