Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms