Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms