Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT5

Sdf2, Stromal cell-derived factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdf2Q9DCT5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdf2Q9DCT5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdf2Q9DCT5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdf2Q9DCT5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdf2Q9DCT5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms