Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnft1Q9DCN7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms