Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms