Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms