Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx6Q9DBY5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx6Q9DBY5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx6Q9DBY5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx6Q9DBY5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx6Q9DBY5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx6Q9DBY5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx6Q9DBY5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx6Q9DBY5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms