Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms