Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtr1Q9DBC3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtr1Q9DBC3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtr1Q9DBC3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtr1Q9DBC3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtr1Q9DBC3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtr1Q9DBC3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtr1Q9DBC3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtr1Q9DBC3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtr1Q9DBC3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtr1Q9DBC3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms