Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms