Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms