Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA59

1700020A23Rik, MCG9903, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700020A23RikQ9DA59 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700020A23RikQ9DA59 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700020A23RikQ9DA59 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700020A23RikQ9DA59 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700020A23RikQ9DA59 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700020A23RikQ9DA59 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700020A23RikQ9DA59 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
1700020A23RikQ9DA59 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700020A23RikQ9DA59 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
1700020A23RikQ9DA59 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700020A23RikQ9DA59 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
1700020A23RikQ9DA59 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700020A23RikQ9DA59 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700020A23RikQ9DA59 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700020A23RikQ9DA59 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700020A23RikQ9DA59 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700020A23RikQ9DA59 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700020A23RikQ9DA59 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700020A23RikQ9DA59 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700020A23RikQ9DA59 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700020A23RikQ9DA59 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700020A23RikQ9DA59 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700020A23RikQ9DA59 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700020A23RikQ9DA59 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700020A23RikQ9DA59 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700020A23RikQ9DA59 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700020A23RikQ9DA59 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700020A23RikQ9DA59 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700020A23RikQ9DA59 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms