Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DA42 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DA42 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DA42 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DA42 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DA42 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DA42 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DA42 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9DA42 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9DA42 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9DA42 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9DA42 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9DA42 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9DA42 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9DA42 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9DA42 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9DA42 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9DA42 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9DA42 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9DA42 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9DA42 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9DA42 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9DA42 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9DA42 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9DA42 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9DA42 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9DA42 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9DA42 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9DA42 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9DA42 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9DA42 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9DA42 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9DA42 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9DA42 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9DA42 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9DA42 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9DA42 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9DA42 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9DA42 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9DA42 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9DA42 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9DA42 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9DA42 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9DA42 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9DA42 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9DA42 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9DA42 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9DA42 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9DA42 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9DA42 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DA42 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DA42 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DA42 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DA42 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DA42 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DA42 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DA42 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DA42 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DA42 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DA42 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DA42 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DA42 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DA42 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DA42 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DA42 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DA42 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DA42 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DA42 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DA42 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DA42 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DA42 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DA42 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms