Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smco2Q9DA21 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms