Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms