Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd9Q9D9M4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd9Q9D9M4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd9Q9D9M4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd9Q9D9M4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd9Q9D9M4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd9Q9D9M4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd9Q9D9M4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd9Q9D9M4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd9Q9D9M4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd9Q9D9M4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd9Q9D9M4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd9Q9D9M4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzd9Q9D9M4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzd9Q9D9M4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzd9Q9D9M4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzd9Q9D9M4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzd9Q9D9M4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzd9Q9D9M4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzd9Q9D9M4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzd9Q9D9M4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzd9Q9D9M4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzd9Q9D9M4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzd9Q9D9M4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzd9Q9D9M4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
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