Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Chmp4cQ9D7F7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp4cQ9D7F7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp4cQ9D7F7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms