Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms