Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms