Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cmtm5Q9D6G9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cmtm5Q9D6G9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cmtm5Q9D6G9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cmtm5Q9D6G9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cmtm5Q9D6G9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cmtm5Q9D6G9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cmtm5Q9D6G9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cmtm5Q9D6G9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cmtm5Q9D6G9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms