Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms