Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Rab11fip1Q9D620 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Rab11fip1Q9D620 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Rab11fip1Q9D620 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Rab11fip1Q9D620 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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