Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms