Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms