Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4931428L18RikQ9D4S9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4931428L18RikQ9D4S9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms