Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf6Q9D4J7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf6Q9D4J7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms